4月26日，海协会和海基会在南京签署《海峡两岸共同打击罪犯及司法互助协议》、《海峡两岸金融合作协议》和《海峡两岸空运补充协议》3项协议。在《海峡两岸金融合作协议》中，双方同意由两岸金融监督管理机关分别建立两岸银行、证券期货以及保险业的监督管理合作机制，规范了互设机构及检查方式等事宜；并针对货币管理资讯互换，确定了合作的方向与运作的原则，对两岸金融机构准入及开展业务等事宜，也明确指出双方同意将进行磋商。在《海峡两岸空运补充协议》中，在双方平日包机的基础上，达成定期航班的安排，并同意增开两条航线，航班增至每周270个往返班次，大陆另增加哈尔滨、济南、合肥、南昌等6个航点等。此外，关于开放大陆资本赴台湾投资事宜，双方达成共识，应秉持优势互补、互利双赢的原则，积极鼓励并推动大陆企业赴台考察、投资，以加强和深化两岸产业合作，实现两岸经贸关系正常化。