据报道，肯尼亚港务局(KPA)计划在蒙巴萨港第二个集装箱码头开展二期工程。整个码头吞吐量预计会达到每年150万标准箱。据《肯尼亚工程师报》（Kenya Engineer）报道，肯尼亚港务局已从日本国际协力机构获得3.34亿美元的贷款。二期工程将建造22号泊位，年吞吐量将达到45万标准箱。据报道，二期工程已进入采购阶段，预计将于2018年1月开工。